| Groupe L | 15.09.2016 | Villarreal CF | - | FC Zürich | 2:1 | ||||
| Groupe L | 20.10.2016 | Osmanlıspor FK | - | Villarreal CF | 2:2 | ||||
| Groupe L | 03.11.2016 | Villarreal CF | - | Osmanlıspor FK | 1:2 | ||||
| Groupe L | 24.11.2016 | FC Zürich | - | Villarreal CF | 1:1 | ||||
| Groupe L | 08.12.2016 | Villarreal CF | - | FC Steaua Bucureşti | 2:1 |  |
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| Seizièmes de finale | 16.02.2017 | Villarreal CF | - | AS Roma | 0:4 |
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