| 5. Journée | 21.09.2008 | SpVgg Unterhaching II | - | SC Pfullendorf | 0:2 | ||||
| 6. Journée | 26.09.2008 | SSV Ulm 1846 | - | SpVgg Unterhaching II | 3:0 |  |
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| 7. Journée | 05.10.2008 | SpVgg Unterhaching II | - | 1. FC Eintracht Bamberg | 2:4 |  |
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| 9. Journée | 25.10.2008 | SpVgg Unterhaching II | - | Hessen Kassel | 1:4 | |
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| 11. Journée | 02.11.2008 | SpVgg Unterhaching II | - | SpVgg Greuther Fürth II | 0:1 | ||||
| 15. Journée | 30.11.2008 | SpVgg Unterhaching II | - | 1. FC Heidenheim 1846 | 0:2 | ||||
| 16. Journée | 06.12.2008 | TSV Großbardorf | - | SpVgg Unterhaching II | 6:1 | ||||
| 21. Journée | 08.03.2009 | SpVgg Unterhaching II | - | 1. FC Nürnberg II | 1:1 | ||||
| 22. Journée | 18.03.2009 | SC Pfullendorf | - | SpVgg Unterhaching II | 3:1 | ||||
| 28. Journée | 02.05.2009 | SpVgg Greuther Fürth II | - | SpVgg Unterhaching II | 1:0 | ||||
| 29. Journée | 10.05.2009 | SpVgg Unterhaching II | - | Waldhof Mannheim | 1:2 | ||||
| 31. Journée | 17.05.2009 | SpVgg Unterhaching II | - | SSV Reutlingen | 0:1 | ||||
| 33. Journée | 30.05.2009 | SpVgg Unterhaching II | - | TSV Großbardorf | 2:1 | |
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| 34. Journée | 06.06.2009 | SV Darmstadt 98 | - | SpVgg Unterhaching II | 6:3 | |
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