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| Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour | 1. Mi-temps | » 2. Mi-temps |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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FC Augsburg | 32 | 17 | 11 | 4 | 32:11 | 21 | 62 |
| 2 |
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Hertha BSC | 32 | 16 | 8 | 8 | 34:16 | 18 | 56 |
| 3 |
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Energie Cottbus | 32 | 16 | 7 | 9 | 37:23 | 14 | 55 |
| 4 |
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MSV Duisburg | 32 | 14 | 10 | 8 | 31:19 | 12 | 52 |
| 5 |
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SpVgg Greuther Fürth | 32 | 14 | 9 | 9 | 24:15 | 9 | 51 |
| 6 |
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TSV 1860 München | 32 | 12 | 13 | 7 | 27:21 | 6 | 49 |
| 7 |
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VfL Bochum | 32 | 12 | 11 | 9 | 22:17 | 5 | 47 |
| 8 |
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Erzgebirge Aue | 32 | 12 | 11 | 9 | 26:23 | 3 | 47 |
| 9 |
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Fortuna Düsseldorf | 32 | 13 | 8 | 11 | 24:25 | -1 | 47 |
| 10 |
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Alemannia Aachen | 32 | 9 | 15 | 8 | 31:30 | 1 | 42 |
| 11 |
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1. FC Union Berlin | 32 | 11 | 9 | 12 | 23:23 | 0 | 42 |
| 12 |
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VfL Osnabrück | 32 | 10 | 7 | 15 | 23:33 | -10 | 37 |
| 13 |
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FSV Frankfurt | 32 | 9 | 9 | 14 | 25:30 | -5 | 36 |
| 14 |
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SC Paderborn 07 | 32 | 8 | 10 | 14 | 19:27 | -8 | 34 |
| 15 |
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Rot-Weiß Oberhausen | 32 | 8 | 7 | 17 | 17:38 | -21 | 31 |
| 16 |
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FC Ingolstadt 04 | 32 | 6 | 12 | 14 | 21:31 | -10 | 30 |
| 17 |
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Arminia Bielefeld | 32 | 6 | 12 | 14 | 18:30 | -12 | 30 |
| 18 |
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Karlsruher SC | 32 | 4 | 13 | 15 | 20:42 | -22 | 25 |
| Promotion | |
| Relégation | |
| Relégation | |
| Relégation |
