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| Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour | » 1. Mi-temps | 2. Mi-temps |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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Hertha BSC | 32 | 15 | 14 | 3 | 31:11 | 20 | 59 |
| 2 |
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FC Augsburg | 32 | 14 | 11 | 7 | 23:13 | 10 | 53 |
| 3 |
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Fortuna Düsseldorf | 32 | 13 | 12 | 7 | 21:12 | 9 | 51 |
| 4 |
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SpVgg Greuther Fürth | 32 | 12 | 15 | 5 | 18:10 | 8 | 51 |
| 5 |
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VfL Bochum | 32 | 13 | 12 | 7 | 21:16 | 5 | 51 |
| 6 |
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TSV 1860 München | 32 | 12 | 13 | 7 | 20:11 | 9 | 49 |
| 7 |
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FC Ingolstadt 04 | 32 | 10 | 15 | 7 | 18:13 | 5 | 45 |
| 8 |
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Alemannia Aachen | 32 | 11 | 12 | 9 | 25:26 | -1 | 45 |
| 9 |
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Erzgebirge Aue | 32 | 7 | 19 | 6 | 12:12 | 0 | 40 |
| 10 |
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Karlsruher SC | 32 | 10 | 10 | 12 | 22:26 | -4 | 40 |
| 11 |
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MSV Duisburg | 32 | 7 | 18 | 7 | 18:15 | 3 | 39 |
| 12 |
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Energie Cottbus | 32 | 9 | 11 | 12 | 23:24 | -1 | 38 |
| 13 |
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SC Paderborn 07 | 32 | 5 | 20 | 7 | 9:15 | -6 | 35 |
| 14 |
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VfL Osnabrück | 32 | 6 | 15 | 11 | 15:26 | -11 | 33 |
| 15 |
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FSV Frankfurt | 32 | 5 | 16 | 11 | 16:20 | -4 | 31 |
| 16 |
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1. FC Union Berlin | 32 | 3 | 20 | 9 | 10:17 | -7 | 29 |
| 17 |
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Rot-Weiß Oberhausen | 32 | 3 | 18 | 11 | 11:20 | -9 | 27 |
| 18 |
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Arminia Bielefeld | 32 | 3 | 9 | 20 | 7:33 | -26 | 18 |
| Promotion | |
| Relégation | |
| Relégation | |
| Relégation |
