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| Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour | » 1. Mi-temps | 2. Mi-temps |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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Hertha BSC | 29 | 13 | 13 | 3 | 28:11 | 17 | 52 |
| 2 |
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FC Augsburg | 29 | 12 | 11 | 6 | 20:11 | 9 | 47 |
| 3 |
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SpVgg Greuther Fürth | 29 | 11 | 14 | 4 | 17:8 | 9 | 47 |
| 4 |
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VfL Bochum | 29 | 12 | 11 | 6 | 20:14 | 6 | 47 |
| 5 |
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Fortuna Düsseldorf | 29 | 11 | 12 | 6 | 18:10 | 8 | 45 |
| 6 |
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TSV 1860 München | 29 | 10 | 12 | 7 | 17:11 | 6 | 42 |
| 7 |
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FC Ingolstadt 04 | 29 | 9 | 13 | 7 | 16:13 | 3 | 40 |
| 8 |
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Erzgebirge Aue | 29 | 7 | 17 | 5 | 11:10 | 1 | 38 |
| 9 |
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Alemannia Aachen | 29 | 9 | 11 | 9 | 21:24 | -3 | 38 |
| 10 |
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Karlsruher SC | 29 | 9 | 9 | 11 | 19:24 | -5 | 36 |
| 11 |
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MSV Duisburg | 29 | 6 | 17 | 6 | 16:14 | 2 | 35 |
| 12 |
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Energie Cottbus | 29 | 8 | 10 | 11 | 22:23 | -1 | 34 |
| 13 |
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SC Paderborn 07 | 29 | 5 | 17 | 7 | 9:15 | -6 | 32 |
| 14 |
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VfL Osnabrück | 29 | 6 | 13 | 10 | 14:23 | -9 | 31 |
| 15 |
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FSV Frankfurt | 29 | 5 | 15 | 9 | 15:16 | -1 | 30 |
| 16 |
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1. FC Union Berlin | 29 | 3 | 19 | 7 | 10:14 | -4 | 28 |
| 17 |
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Rot-Weiß Oberhausen | 29 | 2 | 17 | 10 | 9:18 | -9 | 23 |
| 18 |
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Arminia Bielefeld | 29 | 3 | 9 | 17 | 7:30 | -23 | 18 |
| Promotion | |
| Relégation | |
| Relégation | |
| Relégation |
