| 6. Journée | 03.09.2016 | VfL Wolfsburg II | - | VfB Lübeck | 2:1 | ||||
| 7. Journée | 11.09.2016 | VfB Lübeck | - | SV Meppen | 1:2 | ||||
| 8. Journée | 17.09.2016 | Lüneburger SK Hansa | - | VfB Lübeck | 0:1 | ||||
| 9. Journée | 23.09.2016 | VfB Lübeck | - | Eintracht Norderstedt | 3:1 | ||||
| 10. Journée | 02.10.2016 | VfB Oldenburg | - | VfB Lübeck | 3:0 | ||||
| 11. Journée | 08.10.2016 | VfB Lübeck | - | Hamburger SV II | 3:1 | ||||
| 12. Journée | 16.10.2016 | SV Eichede | - | VfB Lübeck | 0:1 | ||||
| 13. Journée | 23.10.2016 | VfB Lübeck | - | Hannover 96 II | 4:1 | ||||
| 14. Journée | 29.10.2016 | U.S.I. Lupo-Martini | - | VfB Lübeck | 2:2 | ||||
| 15. Journée | 06.11.2016 | VfB Lübeck | - | Eintracht Braunschweig II | 1:0 |  |
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| 16. Journée | 13.11.2016 | ETSV Weiche Flensburg | - | VfB Lübeck | 0:2 | |
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| 17. Journée | 19.11.2016 | VfB Lübeck | - | Schwarz-Weiß Rehden | 2:2 | ||||
| 18. Journée | 27.11.2016 | VfV Hildesheim | - | VfB Lübeck | 1:1 | ||||
| 19. Journée | 03.12.2016 | Germania Egestorf/Langreder | - | VfB Lübeck | 2:1 |  |
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| 20. Journée | 05.02.2017 | VfB Lübeck | - | FC St. Pauli II | 1:1 | |
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| 23. Journée | 25.02.2017 | VfB Lübeck | - | VfL Wolfsburg II | 2:0 | |
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| 24. Journée | 05.03.2017 | SV Meppen | - | VfB Lübeck | 2:1 |
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