| 18. Journée | 23.01.1999 | Chemnitzer FC | - | SV Babelsberg 03 | 4:0 | ||||
| 20. Journée | 06.02.1999 | 1. FC Union Berlin | - | SV Babelsberg 03 | 3:0 | ||||
| 24. Journée | 06.03.1999 | SV Babelsberg 03 | - | FC Berlin | 0:0 | ||||
| 22. Journée | 16.03.1999 | FSV Zwickau | - | SV Babelsberg 03 | 1:1 | ||||
| 25. Journée | 20.03.1999 | VfB Leipzig | - | SV Babelsberg 03 | 1:1 |  |
|||
| 26. Journée | 27.03.1999 | SV Babelsberg 03 | - | VFC Plauen | 4:1 | ||||
| 27. Journée | 01.04.1999 | Dresdner SC | - | SV Babelsberg 03 | 1:1 |  |
|||
| 28. Journée | 05.04.1999 | SV Babelsberg 03 | - | Lok Altmark Stendal | 1:1 | ||||
| 29. Journée | 10.04.1999 | Rot-Weiß Erfurt | - | SV Babelsberg 03 | 1:4 | |
|||
| 30. Journée | 17.04.1999 | SV Babelsberg 03 | - | Erzgebirge Aue | 2:1 | ||||
| 31. Journée | 25.04.1999 | Spandauer SV | - | SV Babelsberg 03 | 2:2 | ||||
| 33. Journée | 08.05.1999 | Sachsen Leipzig | - | SV Babelsberg 03 | 1:0 | ||||
| 34. Journée | 15.05.1999 | SV Babelsberg 03 | - | Dynamo Dresden | 1:1 |
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