| 1. Journée | 16.08.2008 | SV Wehen Wiesbaden II | - | SpVgg Unterhaching II | 5:2 |  |
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| 2. Journée | 24.08.2008 | SpVgg Unterhaching II | - | Viktoria Aschaffenburg | 1:2 |  |
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| 3. Journée | 31.08.2008 | SpVgg Unterhaching II | - | Karlsruher SC II | 2:2 | |
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| 4. Journée | 13.09.2008 | 1. FC Nürnberg II | - | SpVgg Unterhaching II | 1:2 | |
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| 5. Journée | 21.09.2008 | SpVgg Unterhaching II | - | SC Pfullendorf | 0:2 |  |
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| 11. Journée | 02.11.2008 | SpVgg Unterhaching II | - | SpVgg Greuther Fürth II | 0:1 | |
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| 15. Journée | 30.11.2008 | SpVgg Unterhaching II | - | 1. FC Heidenheim 1846 | 0:2 | ||||
| 29. Journée | 10.05.2009 | SpVgg Unterhaching II | - | Waldhof Mannheim | 1:2 |
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