| 3. Journée | 10.08.2016 | Chemnitzer FC | - | FSV Frankfurt | 2:1 | ||||
| 5. Journée | 27.08.2016 | Hansa Rostock | - | FSV Frankfurt | 1:1 |  |
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| 6. Journée | 10.09.2016 | FSV Frankfurt | - | SG Sonnenhof Großaspach | 1:3 | ||||
| 7. Journée | 17.09.2016 | Hallescher FC | - | FSV Frankfurt | 1:1 | ||||
| 16. Journée | 27.11.2016 | 1. FSV Mainz 05 II | - | FSV Frankfurt | 1:0 | ||||
| 17. Journée | 04.12.2016 | FSV Frankfurt | - | 1. FC Magdeburg | 0:1 | ||||
| 18. Journée | 10.12.2016 | Werder Bremen II | - | FSV Frankfurt | 0:0 | ||||
| 19. Journée | 17.12.2016 | FSV Frankfurt | - | SV Wehen Wiesbaden | 3:1 | |
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| 20. Journée | 28.01.2017 | FSV Frankfurt | - | Holstein Kiel | 0:0 | ||||
| 21. Journée | 04.02.2017 | Rot-Weiß Erfurt | - | FSV Frankfurt | 1:0 | ||||
| 25. Journée | 04.03.2017 | SG Sonnenhof Großaspach | - | FSV Frankfurt | 3:1 | ||||
| 26. Journée | 11.03.2017 | FSV Frankfurt | - | Hallescher FC | 0:1 | ||||
| 31. Journée | 05.04.2017 | FSV Frankfurt | - | FSV Zwickau | 0:1 |
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