| 20. Journée | 17.02.2012 | Energie Cottbus II | - | 1. FC Magdeburg | 1:0 | ||||
| 21. Journée | 26.02.2012 | 1. FC Magdeburg | - | FC St. Pauli II | 2:2 |  |
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| 18. Journée | 07.03.2012 | Hertha BSC II | - | 1. FC Magdeburg | 2:0 |  |
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| 23. Journée | 11.03.2012 | 1. FC Magdeburg | - | RB Leipzig | 0:3 | |
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| 19. Journée | 14.03.2012 | 1. FC Magdeburg | - | VFC Plauen | 0:0 | ||||
| 24. Journée | 17.03.2012 | Holstein Kiel | - | 1. FC Magdeburg | 1:0 | ||||
| 25. Journée | 25.03.2012 | 1. FC Magdeburg | - | Berliner AK 07 | 1:2 | ||||
| 26. Journée | 01.04.2012 | Germania Halberstadt | - | 1. FC Magdeburg | 1:2 | |
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| 30. Journée | 21.04.2012 | Hamburger SV II | - | 1. FC Magdeburg | 2:2 | ||||
| 34. Journée | 19.05.2012 | Hannover 96 II | - | 1. FC Magdeburg | 1:1 | |
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