| 5. Journée | 19.09.2008 | SV Darmstadt 98 | - | 1. FC Eintracht Bamberg | 5:2 | ||||
| 6. Journée | 26.09.2008 | 1. FC Eintracht Bamberg | - | SV Wehen Wiesbaden II | 0:4 | ||||
| 7. Journée | 05.10.2008 | SpVgg Unterhaching II | - | 1. FC Eintracht Bamberg | 2:4 |  |
|||
| 8. Journée | 18.10.2008 | 1. FC Eintracht Bamberg | - | Karlsruher SC II | 2:0 | ||||
| 9. Journée | 25.10.2008 | 1. FC Nürnberg II | - | 1. FC Eintracht Bamberg | 2:2 | ||||
| 10. Journée | 29.10.2008 | 1. FC Eintracht Bamberg | - | SC Pfullendorf | 1:1 | ||||
| 11. Journée | 01.11.2008 | SSV Ulm 1846 | - | 1. FC Eintracht Bamberg | 2:2 | ||||
| 15. Journée | 29.11.2008 | 1. FC Eintracht Bamberg | - | SC Freiburg II | 2:0 | ||||
| 16. Journée | 06.12.2008 | SpVgg Greuther Fürth II | - | 1. FC Eintracht Bamberg | 3:1 | ||||
| 17. Journée | 17.12.2008 | 1. FC Eintracht Bamberg | - | Waldhof Mannheim | 2:0 |  |
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