| 5. Journée | 03.09.2005 | SV Darmstadt 98 | - | Bayern München II | 1:0 | ||||
| 6. Journée | 11.09.2005 | Bayern München II | - | Stuttgarter Kickers | 1:0 | ||||
| 7. Journée | 16.09.2005 | TSG Hoffenheim | - | Bayern München II | 1:0 | ||||
| 8. Journée | 21.09.2005 | Bayern München II | - | SV 07 Elversberg | 0:0 | ||||
| 9. Journée | 24.09.2005 | TuS Koblenz | - | Bayern München II | 4:0 | ||||
| 10. Journée | 02.10.2005 | Bayern München II | - | FC Augsburg | 0:3 | ||||
| 15. Journée | 12.11.2005 | Karlsruher SC II | - | Bayern München II | 1:0 | ||||
| 18. Journée | 15.11.2005 | Jahn Regensburg | - | Bayern München II | 1:0 | ||||
| 25. Journée | 25.03.2006 | SV 07 Elversberg | - | Bayern München II | 1:0 | ||||
| 27. Journée | 08.04.2006 | FC Augsburg | - | Bayern München II | 1:0 | ||||
| 33. Journée | 20.05.2006 | 1. FC Kaiserslautern II | - | Bayern München II | 3:0 | ||||
| 34. Journée | 27.05.2006 | Bayern München II | - | Eintracht Trier | 1:1 |
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