| 5. Journée | 29.08.1998 | Wuppertaler SV | - | Preußen Münster | 2:1 | ||||
| 6. Journée | 06.09.1998 | Preußen Münster | - | LR Ahlen | 1:1 | ||||
| 7. Journée | 12.09.1998 | Eintracht Trier | - | Preußen Münster | 3:1 | ||||
| 8. Journée | 20.09.1998 | Preußen Münster | - | Borussia Dortmund II | 3:2 | ||||
| 9. Journée | 27.09.1998 | 1. FC Saarbrücken | - | Preußen Münster | 1:1 | ||||
| 10. Journée | 02.10.1998 | Preußen Münster | - | 1. FC Kaiserslautern II | 1:1 | ||||
| 11. Journée | 10.10.1998 | SC Paderborn 07 | - | Preußen Münster | 1:3 | ||||
| 22. Journée | 27.02.1999 | Preußen Münster | - | Wuppertaler SV | 3:0 |  |
|||
| 23. Journée | 07.03.1999 | LR Ahlen | - | Preußen Münster | 1:1 | ||||
| 19. Journée | 11.03.1999 | Preußen Münster | - | SV 07 Elversberg | 3:0 |  |
|||
| 24. Journée | 14.03.1999 | Preußen Münster | - | Eintracht Trier | 1:3 | ||||
| 25. Journée | 21.03.1999 | Borussia Dortmund II | - | Preußen Münster | 3:2 | ||||
| 27. Journée | 11.04.1999 | 1. FC Kaiserslautern II | - | Preußen Münster | 0:1 |
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