| 9. Journée | 27.08.2016 | Würzburger Kickers II | - | SpVgg Ansbach | 2:1 |  |
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| 10. Journée | 02.09.2016 | SC Eltersdorf | - | Würzburger Kickers II | 0:3 | ||||
| 11. Journée | 10.09.2016 | SV Erlenbach | - | Würzburger Kickers II | 1:1 | ||||
| 12. Journée | 17.09.2016 | Würzburger Kickers II | - | TSV Aubstadt | 2:1 | ||||
| 13. Journée | 25.09.2016 | DJK Ammerthal | - | Würzburger Kickers II | 1:1 | ||||
| 14. Journée | 01.10.2016 | Würzburger Kickers II | - | VfL Frohnlach | 3:0 | ||||
| 15. Journée | 08.10.2016 | Würzburger FV | - | Würzburger Kickers II | 2:1 | ||||
| 16. Journée | 15.10.2016 | Würzburger Kickers II | - | FC Amberg | 1:0 | ||||
| 17. Journée | 22.10.2016 | SpVgg Weiden | - | Würzburger Kickers II | 1:2 |  |
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| 18. Journée | 30.10.2016 | DJK Bamberg | - | Würzburger Kickers II | 0:1 | ||||
| 19. Journée | 05.11.2016 | Würzburger Kickers II | - | 1. FC Sand | 1:1 |  |
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| 20. Journée | 12.11.2016 | TSV Großbardorf | - | Würzburger Kickers II | 2:0 | ||||
| 21. Journée | 19.11.2016 | Würzburger Kickers II | - | ASV Neumarkt | 2:1 | ||||
| 22. Journée | 27.11.2016 | Alemannia Haibach | - | Würzburger Kickers II | 1:1 |
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