| 5. Journée | 03.09.2011 | Stuttgarter Kickers | - | Bayern Alzenau | 4:0 | ||||
| 19. Journée | 26.11.2011 | Hessen Kassel | - | Bayern Alzenau | 1:1 | ||||
| 20. Journée | 03.12.2011 | Bayern Alzenau | - | SC Pfullendorf | 3:2 | ||||
| 22. Journée | 03.03.2012 | Bayern Alzenau | - | Stuttgarter Kickers | 1:3 |  |
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| 23. Journée | 13.03.2012 | 1. FC Nürnberg II | - | Bayern Alzenau | 4:0 | ||||
| 24. Journée | 17.03.2012 | Bayern Alzenau | - | Bayern München II | 1:1 | |
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| 25. Journée | 24.03.2012 | Karlsruher SC II | - | Bayern Alzenau | 1:0 | ||||
| 26. Journée | 30.03.2012 | Bayern Alzenau | - | Waldhof Mannheim | 1:2 | ||||
| 27. Journée | 05.04.2012 | SG Sonnenhof Großaspach | - | Bayern Alzenau | 4:2 | ||||
| 28. Journée | 11.04.2012 | Bayern Alzenau | - | SC Freiburg II | 0:1 |  |
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| 29. Journée | 14.04.2012 | FC Memmingen | - | Bayern Alzenau | 2:0 | ||||
| 30. Journée | 22.04.2012 | FSV Frankfurt II | - | Bayern Alzenau | 2:2 | ||||
| 31. Journée | 29.04.2012 | Bayern Alzenau | - | Eintracht Frankfurt II | 1:0 | ||||
| 32. Journée | 05.05.2012 | SpVgg Greuther Fürth II | - | Bayern Alzenau | 4:4 | ||||
| 33. Journée | 12.05.2012 | Bayern Alzenau | - | TSV 1860 München II | 5:1 | |
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| 34. Journée | 18.05.2012 | 1899 Hoffenheim II | - | Bayern Alzenau | 5:0 | |
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