| 20. Journée | 11.02.2017 | FC Carl Zeiss Jena | - | FSV Budissa Bautzen | 4:0 | ||||
| 22. Journée | 26.02.2017 | Union Fürstenwalde | - | FC Carl Zeiss Jena | 1:2 | ||||
| 21. Journée | 26.03.2017 | SV Babelsberg 03 | - | FC Carl Zeiss Jena | 1:1 |  |
|||
| 27. Journée | 09.04.2017 | FC Carl Zeiss Jena | - | FSV 63 Luckenwalde | 3:0 | ||||
| 30. Journée | 23.04.2017 | 1. FC Lok Leipzig | - | FC Carl Zeiss Jena | 1:2 |  |
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| 31. Journée | 28.04.2017 | FC Carl Zeiss Jena | - | RB Leipzig II | 1:1 | ||||
| 32. Journée | 07.05.2017 | FC Schönberg 95 | - | FC Carl Zeiss Jena | 2:1 | ||||
| 33. Journée | 13.05.2017 | FC Carl Zeiss Jena | - | FC Viktoria 1889 Berlin | 0:2 | |
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