| 5. Journée | 02.09.2009 | FC St. Pauli II | - | Hertha BSC II | 3:1 | ||||
| 14. Journée | 06.11.2009 | Hansa Rostock II | - | FC St. Pauli II | 0:0 | ||||
| 15. Journée | 22.11.2009 | FC St. Pauli II | - | VFC Plauen | 3:2 | ||||
| 18. Journée | 09.12.2009 | FC St. Pauli II | - | Hannover 96 II | 2:1 | ||||
| 19. Journée | 19.12.2009 | Hallescher FC | - | FC St. Pauli II | 1:0 | ||||
| 25. Journée | 20.03.2010 | FC St. Pauli II | - | FC Oberneuland | 4:4 | ||||
| 26. Journée | 27.03.2010 | TeBe Berlin | - | FC St. Pauli II | 2:1 | ||||
| 21. Journée | 30.03.2010 | VfB Lübeck | - | FC St. Pauli II | 0:0 |  |
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