| 3. Journée | 19.08.2011 | Bayern München II | - | Karlsruher SC II | 2:5 | ||||
| 21. Journée | 12.12.2011 | Bayern München II | - | Waldhof Mannheim | 2:2 | ||||
| 22. Journée | 02.03.2012 | SG Sonnenhof Großaspach | - | Bayern München II | 3:2 | ||||
| 24. Journée | 17.03.2012 | Bayern Alzenau | - | Bayern München II | 1:1 | ||||
| 25. Journée | 25.03.2012 | Bayern München II | - | FSV Frankfurt II | 0:2 | ||||
| 26. Journée | 01.04.2012 | Eintracht Frankfurt II | - | Bayern München II | 2:1 | ||||
| 27. Journée | 05.04.2012 | Bayern München II | - | SpVgg Greuther Fürth II | 2:3 | ||||
| 28. Journée | 10.04.2012 | TSV 1860 München II | - | Bayern München II | 0:1 | ||||
| 29. Journée | 15.04.2012 | Bayern München II | - | 1899 Hoffenheim II | 1:1 | ||||
| 30. Journée | 21.04.2012 | Wormatia Worms | - | Bayern München II | 0:0 |
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