| 2. Journée | 02.08.2008 | VfR Aalen | - | Jahn Regensburg | 1:1 | ||||
| 3. Journée | 16.08.2008 | Erzgebirge Aue | - | VfR Aalen | 0:0 | ||||
| 4. Journée | 23.08.2008 | VfR Aalen | - | Rot-Weiß Erfurt | 0:2 |  |
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| 11. Journée | 25.10.2008 | Dynamo Dresden | - | VfR Aalen | 1:1 | ||||
| 12. Journée | 29.10.2008 | VfR Aalen | - | Eintracht Braunschweig | 2:0 | ||||
| 13. Journée | 01.11.2008 | FC Carl Zeiss Jena | - | VfR Aalen | 1:1 | ||||
| 14. Journée | 07.11.2008 | VfR Aalen | - | Wacker Burghausen | 0:0 |  |
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| 15. Journée | 15.11.2008 | VfR Aalen | - | Werder Bremen II | 1:0 | ||||
| 16. Journée | 22.11.2008 | SC Paderborn 07 | - | VfR Aalen | 4:0 | ||||
| 19. Journée | 13.12.2008 | VfR Aalen | - | SpVgg Unterhaching | 2:3 | ||||
| 20. Journée | 21.12.2008 | VfR Aalen | - | SV Sandhausen | 0:0 | ||||
| 21. Journée | 08.02.2009 | Jahn Regensburg | - | VfR Aalen | 1:0 | ||||
| 28. Journée | 29.03.2009 | VfR Aalen | - | 1. FC Union Berlin | 1:4 | |
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| 29. Journée | 01.04.2009 | Wuppertaler SV | - | VfR Aalen | 5:0 |
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