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| Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour | 1. Mi-temps | » 2. Mi-temps |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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SSV Ulm 1846 (N) | 36 | 18 | 10 | 8 | 33:18 | 15 | 64 |
| 2 |
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Dynamo Dresden | 36 | 16 | 12 | 8 | 28:18 | 10 | 60 |
| 3 |
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Preußen Münster (N) | 36 | 14 | 15 | 7 | 39:26 | 13 | 57 |
| 4 |
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FC Ingolstadt 04 | 36 | 16 | 8 | 12 | 35:26 | 9 | 56 |
| 5 |
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Rot-Weiss Essen | 36 | 15 | 11 | 10 | 35:28 | 7 | 56 |
| 6 |
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Erzgebirge Aue | 36 | 13 | 15 | 8 | 31:23 | 8 | 54 |
| 7 |
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1. FC Saarbrücken | 36 | 11 | 18 | 7 | 34:22 | 12 | 51 |
| 8 |
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Jahn Regensburg (A) | 36 | 12 | 15 | 9 | 26:25 | 1 | 51 |
| 9 |
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Borussia Dortmund II | 36 | 12 | 14 | 10 | 29:25 | 4 | 50 |
| 10 |
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Viktoria Köln | 36 | 13 | 11 | 12 | 39:40 | -1 | 50 |
| 11 |
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SpVgg Unterhaching (N) | 36 | 12 | 12 | 12 | 23:31 | -8 | 48 |
| 12 |
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TSV 1860 München | 36 | 11 | 13 | 12 | 20:23 | -3 | 46 |
| 13 |
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SC Verl | 36 | 9 | 17 | 10 | 29:27 | 2 | 44 |
| 14 |
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SV Sandhausen (A) | 36 | 10 | 14 | 12 | 27:33 | -6 | 44 |
| 15 |
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Hallescher FC | 36 | 12 | 7 | 17 | 25:33 | -8 | 43 |
| 16 |
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Waldhof Mannheim | 36 | 11 | 8 | 17 | 29:34 | -5 | 41 |
| 17 |
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Arminia Bielefeld (A) | 36 | 7 | 18 | 11 | 23:25 | -2 | 39 |
| 18 |
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SC Freiburg II | 36 | 7 | 13 | 16 | 18:32 | -14 | 34 |
| 19 |
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MSV Duisburg | 36 | 7 | 12 | 17 | 18:36 | -18 | 33 |
| 20 |
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VfB Lübeck (N) | 36 | 5 | 15 | 16 | 20:36 | -16 | 30 |
| Promotion | |
| Relégation | |
| Relégation |
