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| Classement | équipe recevante | » à l'extérieur | Premier tour | Second tour | 1. Mi-temps | 2. Mi-temps |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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FC Carl Zeiss Jena | 16 | 6 | 5 | 5 | 20:21 | -1 | 23 |
| 2 |
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FC Ingolstadt 04 | 16 | 7 | 2 | 7 | 21:23 | -2 | 23 |
| 3 |
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1. FC Heidenheim 1846 | 15 | 6 | 3 | 6 | 23:24 | -1 | 21 |
| 4 |
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Kickers Offenbach | 16 | 4 | 7 | 5 | 17:17 | 0 | 19 |
| 5 |
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VfB Stuttgart II | 15 | 6 | 1 | 8 | 17:18 | -1 | 19 |
| 6 |
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Werder Bremen II | 16 | 5 | 4 | 7 | 16:26 | -10 | 19 |
| 7 |
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Wuppertaler SV | 15 | 5 | 3 | 7 | 17:18 | -1 | 18 |
| 8 |
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Eintracht Braunschweig | 16 | 3 | 7 | 6 | 15:18 | -3 | 16 |
| 9 |
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Rot-Weiß Erfurt | 15 | 4 | 4 | 7 | 15:20 | -5 | 16 |
| 10 |
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SpVgg Unterhaching | 16 | 4 | 4 | 8 | 19:25 | -6 | 16 |
| 11 |
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SV Wehen Wiesbaden | 15 | 4 | 4 | 7 | 16:26 | -10 | 16 |
| 12 |
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Bayern München II | 15 | 5 | 1 | 9 | 21:33 | -12 | 16 |
| 13 |
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Jahn Regensburg | 15 | 3 | 5 | 7 | 20:22 | -2 | 14 |
| 14 |
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VfL Osnabrück | 15 | 3 | 5 | 7 | 11:17 | -6 | 14 |
| 15 |
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Dynamo Dresden | 16 | 3 | 5 | 8 | 10:18 | -8 | 14 |
| 16 |
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Borussia Dortmund II | 16 | 4 | 2 | 10 | 21:30 | -9 | 14 |
| 17 |
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SV Sandhausen | 15 | 3 | 5 | 7 | 18:28 | -10 | 14 |
| 18 |
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Erzgebirge Aue | 15 | 3 | 4 | 8 | 13:26 | -13 | 13 |
| 19 |
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Wacker Burghausen | 16 | 3 | 4 | 9 | 10:31 | -21 | 13 |
| 20 |
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Holstein Kiel | 16 | 2 | 1 | 13 | 14:36 | -22 | 7 |
| Promotion | |
| Relégation | |
| Relégation |
