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| Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour | 1. Mi-temps | » 2. Mi-temps |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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Eintracht Braunschweig | 25 | 12 | 7 | 6 | 22:11 | 11 | 43 |
| 2 |
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VfL Osnabrück | 25 | 11 | 9 | 5 | 24:11 | 13 | 42 |
| 3 |
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FC Ingolstadt 04 | 25 | 12 | 6 | 7 | 23:14 | 9 | 42 |
| 4 |
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SV Sandhausen | 25 | 11 | 7 | 7 | 24:20 | 4 | 40 |
| 5 |
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Bayern München II | 25 | 9 | 11 | 5 | 22:21 | 1 | 38 |
| 6 |
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Kickers Offenbach | 25 | 9 | 10 | 6 | 16:15 | 1 | 37 |
| 7 |
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Rot-Weiß Erfurt | 25 | 10 | 7 | 8 | 15:16 | -1 | 37 |
| 8 |
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Jahn Regensburg | 25 | 9 | 9 | 7 | 20:14 | 6 | 36 |
| 9 |
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Erzgebirge Aue | 25 | 8 | 11 | 6 | 20:17 | 3 | 35 |
| 10 |
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Werder Bremen II | 25 | 10 | 5 | 10 | 19:20 | -1 | 35 |
| 11 |
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FC Carl Zeiss Jena | 25 | 9 | 7 | 9 | 19:18 | 1 | 34 |
| 12 |
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Wuppertaler SV | 25 | 9 | 6 | 10 | 22:26 | -4 | 33 |
| 13 |
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Borussia Dortmund II | 25 | 8 | 7 | 10 | 17:21 | -4 | 31 |
| 14 |
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Holstein Kiel | 25 | 7 | 8 | 10 | 20:22 | -2 | 29 |
| 15 |
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1. FC Heidenheim 1846 | 25 | 6 | 10 | 9 | 24:23 | 1 | 28 |
| 16 |
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SV Wehen Wiesbaden | 25 | 7 | 7 | 11 | 18:24 | -6 | 28 |
| 17 |
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Dynamo Dresden | 25 | 6 | 9 | 10 | 11:16 | -5 | 27 |
| 18 |
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VfB Stuttgart II | 25 | 8 | 3 | 14 | 18:25 | -7 | 27 |
| 19 |
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SpVgg Unterhaching | 25 | 7 | 5 | 13 | 14:22 | -8 | 26 |
| 20 |
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Wacker Burghausen | 25 | 5 | 10 | 10 | 11:23 | -12 | 25 |
| Promotion | |
| Relégation | |
| Relégation |
