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| Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour | 1. Mi-temps | » 2. Mi-temps |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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Erzgebirge Aue | 29 | 13 | 10 | 6 | 19:12 | 7 | 49 |
| 2 |
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1. FSV Mainz 05 | 29 | 11 | 14 | 4 | 24:14 | 10 | 47 |
| 3 |
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1. FC Nürnberg | 29 | 12 | 11 | 6 | 26:20 | 6 | 47 |
| 4 |
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MSV Duisburg | 29 | 11 | 10 | 8 | 24:19 | 5 | 43 |
| 5 |
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Energie Cottbus | 29 | 11 | 9 | 9 | 24:21 | 3 | 42 |
| 6 |
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Karlsruher SC | 29 | 9 | 13 | 7 | 23:20 | 3 | 40 |
| 7 |
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Arminia Bielefeld | 29 | 9 | 13 | 7 | 20:17 | 3 | 40 |
| 8 |
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SpVgg Unterhaching | 29 | 9 | 12 | 8 | 17:19 | -2 | 39 |
| 9 |
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SpVgg Greuther Fürth | 29 | 8 | 14 | 7 | 22:20 | 2 | 38 |
| 10 |
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LR Ahlen | 29 | 8 | 12 | 9 | 21:20 | 1 | 36 |
| 11 |
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VfB Lübeck | 29 | 8 | 12 | 9 | 24:26 | -2 | 36 |
| 12 |
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Rot-Weiß Oberhausen | 29 | 9 | 9 | 11 | 20:25 | -5 | 36 |
| 13 |
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Alemannia Aachen | 29 | 9 | 9 | 11 | 19:24 | -5 | 36 |
| 14 |
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Eintracht Trier | 29 | 9 | 7 | 13 | 22:23 | -1 | 34 |
| 15 |
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1. FC Union Berlin | 29 | 8 | 10 | 11 | 18:22 | -4 | 34 |
| 16 |
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Wacker Burghausen | 29 | 7 | 10 | 12 | 15:21 | -6 | 31 |
| 17 |
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Jahn Regensburg | 29 | 7 | 10 | 12 | 15:24 | -9 | 31 |
| 18 |
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VfL Osnabrück | 29 | 6 | 9 | 14 | 14:20 | -6 | 27 |
