| 1. Journée | 27.08.2006 | CD Alavés | - | Elche CF | 1:1 | ||||
| 2. Journée | 03.09.2006 | Málaga CF | - | CD Alavés | 1:0 |  |
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| 3. Journée | 09.09.2006 | CD Alavés | - | Real Madrid Castilla | 3:1 | ||||
| 4. Journée | 16.09.2006 | UD Vecindario | - | CD Alavés | 0:1 | ||||
| 5. Journée | 23.09.2006 | CD Alavés | - | CD Tenerife | 0:0 | ||||
| 6. Journée | 30.09.2006 | Real Murcia | - | CD Alavés | 1:0 | ||||
| 7. Journée | 08.10.2006 | CD Alavés | - | UD Almería | 1:0 | ||||
| 8. Journée | 15.10.2006 | Cádiz CF | - | CD Alavés | 1:1 | |
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| 9. Journée | 21.10.2006 | CD Alavés | - | CD Castellón | 2:0 | ||||
| 10. Journée | 28.10.2006 | Hércules CF | - | CD Alavés | 3:1 | ||||
| 11. Journée | 05.11.2006 | UD Salamanca | - | CD Alavés | 3:0 | |
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| 12. Journée | 12.11.2006 | CD Alavés | - | Albacete | 1:1 | ||||
| 13. Journée | 19.11.2006 | CD Numancia | - | CD Alavés | 1:1 | ||||
| 14. Journée | 25.11.2006 | CD Alavés | - | Sporting Gijón | 0:0 | ||||
| 15. Journée | 02.12.2006 | UD Las Palmas | - | CD Alavés | 6:1 | |
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| 16. Journée | 09.12.2006 | CD Alavés | - | Ciudad de Murcia | 1:0 | ||||
| 17. Journée | 16.12.2006 | Polideportivo Ejido | - | CD Alavés | 5:2 | ||||
| 18. Journée | 21.12.2006 | CD Alavés | - | Xerez CD | 1:0 |
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