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| 20.08.2013 | 13:00 | JK Narva Trans | - | FC Flora | 1:4 (0:1) | |
| 16:00 | Paide Linnameeskond | - | JK Sillamäe Kalev | 0:3 (0:2) | ||
| 18:30 | FC Infonet | - | JK Tammeka | 3:1 (1:0) | ||
| 10.09.2013 | 17:00 | JK Tallinna Kalev | - | FC Kuressaare | 3:1 (2:0) | |
| 24.09.2013 | 16:00 | JK Nõmme Kalju | - | FC Levadia | 2:1 (1:1) |
| » Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
JK Nõmme Kalju | 24 | 17 | 4 | 3 | 45:16 | 29 | 55 |
| 2 |
|
FC Levadia | 24 | 18 | 1 | 5 | 37:17 | 20 | 55 |
| 3 |
|
JK Sillamäe Kalev | 24 | 15 | 5 | 4 | 41:15 | 26 | 50 |
| 4 |
|
FC Flora | 24 | 15 | 2 | 7 | 55:27 | 28 | 47 |
| 5 |
|
Paide Linnameeskond | 24 | 11 | 1 | 12 | 32:35 | -3 | 34 |
| 6 |
|
FC Infonet | 24 | 6 | 6 | 12 | 21:33 | -12 | 24 |
| 7 |
|
JK Tammeka | 24 | 6 | 6 | 12 | 21:41 | -20 | 24 |
| 8 |
|
JK Narva Trans | 24 | 7 | 2 | 15 | 22:37 | -15 | 23 |
| 9 |
|
JK Tallinna Kalev | 24 | 6 | 3 | 15 | 21:41 | -20 | 21 |
| 10 |
|
FC Kuressaare | 24 | 2 | 4 | 18 | 13:46 | -33 | 10 |
| Champions League Quali. | |
| Europa League Quali. | |
| Relégation | |
| Relégation |
