 |
 |
| A Lyga | 05.03.2016 | FK Atlantas | - | FC Stumbras | 2:0 | 1.200 |
| A Lyga | 16.03.2016 | FK Atlantas | - | Utenis Utena | 1:0 | 300 |
| A Lyga | 02.04.2016 | FK Atlantas | - | Kauno Žalgiris | 3:1 | 600 |
| A Lyga | 06.04.2016 | FK Atlantas | - | FK Žalgiris | 2:1 | 1.100 |
| A Lyga | 27.04.2016 | FK Atlantas | - | FK Sūduva | 1:2 | 850 |
| A Lyga | 08.05.2016 | FK Atlantas | - | FK Jonava | 2:0 | 500 |
| A Lyga | 09.06.2016 | FK Atlantas | - | FK Trakai | 2:2 | 400 |
| A Lyga | 15.06.2016 | FK Atlantas | - | FC Stumbras | 2:0 | 1.200 |
| A Lyga | 12.07.2016 | FK Atlantas | - | Utenis Utena | 2:0 | 500 |
| A Lyga | 27.07.2016 | FK Atlantas | - | Kauno Žalgiris | 1:1 | 500 |
| A Lyga | 02.08.2016 | FK Atlantas | - | FK Žalgiris | 0:1 | 1.000 |
| A Lyga | 24.08.2016 | FK Atlantas | - | FK Sūduva | 2:1 | 750 |
| A Lyga | 15.09.2016 | FK Atlantas | - | FK Jonava | 0:0 | 500 |
| A Lyga | 16.10.2016 | FK Atlantas | - | FK Trakai | 0:1 | 500 |
Lituanie