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| RL Süd | 05.08.2006 | FC Ingolstadt 04 | - | 1. FC Saarbrücken | 0:3 | 3.200 |
| RL Süd | 12.08.2006 | FC Ingolstadt 04 | - | SSV Reutlingen | 1:2 | 1.500 |
| RL Süd | 26.08.2006 | FC Ingolstadt 04 | - | Stuttgarter Kickers | 2:4 | 1.560 |
| RL Süd | 08.09.2006 | FC Ingolstadt 04 | - | TSV 1860 München II | 3:0 | 2.300 |
| RL Süd | 23.09.2006 | FC Ingolstadt 04 | - | TSG Hoffenheim | 0:1 | 3.300 |
| RL Süd | 14.10.2006 | FC Ingolstadt 04 | - | VfR Aalen | 1:1 | 1.500 |
| RL Süd | 28.10.2006 | FC Ingolstadt 04 | - | 1. FC Kaiserslautern II | 4:0 | 1.000 |
| RL Süd | 11.11.2006 | FC Ingolstadt 04 | - | SV Darmstadt 98 | 2:2 | 813 |
| RL Süd | 02.12.2006 | FC Ingolstadt 04 | - | Sportfreunde Siegen | 0:2 | 1.050 |
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