| 1. Journée | 23.07.2012 | FK Krasnodar | - | Rubin Kazan | 2:1 | ||||
| 2. Journée | 30.07.2012 | Terek Grozny | - | FK Krasnodar | 1:0 | ||||
| 3. Journée | 04.08.2012 | FK Krasnodar | - | Lokomotiv Moskva | 3:1 |  |
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| 4. Journée | 10.08.2012 | Kuban Krasnodar (1928-2018) | - | FK Krasnodar | 2:1 | ||||
| 5. Journée | 18.08.2012 | FK Krasnodar | - | FK Rostov | 0:0 | ||||
| 6. Journée | 26.08.2012 | FK Amkar Perm | - | FK Krasnodar | 2:2 | ||||
| 7. Journée | 02.09.2012 | FK Krasnodar | - | CSKA Moskva | 0:1 | ||||
| 8. Journée | 16.09.2012 | Anzhi Makhachkala | - | FK Krasnodar | 5:2 | ||||
| 9. Journée | 21.09.2012 | FK Krasnodar | - | Mordovia Saransk | 6:1 | ||||
| 15. Journée | 11.11.2012 | Spartak Moskva | - | FK Krasnodar | 2:0 | ||||
| 22. Journée | 31.03.2013 | FK Krasnodar | - | Anzhi Makhachkala | 4:0 | ||||
| 25. Journée | 21.04.2013 | Zenit St. Petersburg | - | FK Krasnodar | 1:0 | |
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| 26. Journée | 29.04.2013 | Spartak Vladikavkaz | - | FK Krasnodar | 2:3 |  |
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| 28. Journée | 11.05.2013 | Dinamo Moskva | - | FK Krasnodar | 1:1 | |
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| 29. Journée | 18.05.2013 | FK Krasnodar | - | Spartak Moskva | 0:1 | |
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