| 1. Journée | 02.07.2016 | Sagan Tosu | - | FC Tokyo | 3:2 | ||||
| 2. Journée | 09.07.2016 | FC Tokyo | - | Ventforet Kofu | 1:0 |  |
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| 3. Journée | 13.07.2016 | Avispa Fukuoka | - | FC Tokyo | 2:1 | ||||
| 4. Journée | 17.07.2016 | FC Tokyo | - | Kashiwa Reysol | 0:1 | ||||
| 5. Journée | 23.07.2016 | Kawasaki Frontale | - | FC Tokyo | 1:0 | ||||
| 6. Journée | 30.07.2016 | Albirex Niigata | - | FC Tokyo | 0:1 | ||||
| 7. Journée | 06.08.2016 | FC Tokyo | - | Júbilo Iwata | 3:2 | ||||
| 8. Journée | 13.08.2016 | Vissel Kobe | - | FC Tokyo | 4:1 | ||||
| 9. Journée | 20.08.2016 | FC Tokyo | - | Yokohama F. Marinos | 1:0 | |
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| 10. Journée | 27.08.2016 | Nagoya Grampus | - | FC Tokyo | 1:1 | ||||
| 11. Journée | 10.09.2016 | FC Tokyo | - | Shonan Bellmare | 3:0 | ||||
| 12. Journée | 17.09.2016 | FC Tokyo | - | Urawa Red Diamonds | 1:3 | |
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| 13. Journée | 25.09.2016 | Gamba Osaka | - | FC Tokyo | 3:3 | ||||
| 14. Journée | 01.10.2016 | Sanfrecce Hiroshima | - | FC Tokyo | 0:1 | ||||
| 15. Journée | 22.10.2016 | FC Tokyo | - | Kashima Antlers | 2:1 | ||||
| 16. Journée | 29.10.2016 | FC Tokyo | - | Vegalta Sendai | 1:0 | ||||
| 17. Journée | 03.11.2016 | RB Omiya Ardija | - | FC Tokyo | 0:1 |
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