| 1. Journée | 23.08.1998 | Panathinaikos | - | Paniliakos Pyrgos | 2:1 | ||||
| 2. Journée | 30.08.1998 | AO Proodeftiki | - | Panathinaikos | 1:2 | ||||
| 3. Journée | 13.09.1998 | Panathinaikos | - | Ethnikos Asteras | 4:1 | ||||
| 4. Journée | 20.09.1998 | PAOK Saloniki | - | Panathinaikos | 2:0 | ||||
| 5. Journée | 26.09.1998 | Panathinaikos | - | Ionikos Nikea | 2:1 | ||||
| 7. Journée | 26.10.1998 | Panathinaikos | - | AO Kavala | 6:2 | ||||
| 8. Journée | 31.10.1998 | Panathinaikos | - | Panionios GSS | 2:1 | ||||
| 9. Journée | 08.11.1998 | Ethnikos Piraeus | - | Panathinaikos | 0:0 | ||||
| 10. Journée | 21.11.1998 | Panathinaikos | - | Iraklis Saloniki | 3:2 | ||||
| 11. Journée | 29.11.1998 | Skoda Xanthi | - | Panathinaikos | 1:0 | ||||
| 12. Journée | 05.12.1998 | Panathinaikos | - | Olympiakos Piraeus | 2:4 | ||||
| 13. Journée | 13.12.1998 | AEK Athen | - | Panathinaikos | 2:0 | ||||
| 22. Journée | 07.03.1999 | Ionikos Nikea | - | Panathinaikos | 4:4 |  |
|||
| 23. Journée | 14.03.1999 | Panathinaikos | - | Aris Saloniki | 3:1 | ||||
| 24. Journée | 20.03.1999 | AO Kavala | - | Panathinaikos | 2:1 |
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