| 1. Journée | 06.08.2006 | Hertha BSC II | - | 1. FC Union Berlin | 0:3 |  |
|||
| 2. Journée | 09.08.2006 | SV Wilhelmshaven | - | Hertha BSC II | 0:1 | ||||
| 3. Journée | 13.08.2006 | Hertha BSC II | - | Bayer Leverkusen II | 2:0 | ||||
| 4. Journée | 19.08.2006 | Kickers Emden | - | Hertha BSC II | 1:0 | ||||
| 5. Journée | 26.08.2006 | Hertha BSC II | - | FC St. Pauli | 3:0 | ||||
| 6. Journée | 02.09.2006 | Hamburger SV II | - | Hertha BSC II | 4:1 | ||||
| 7. Journée | 09.09.2006 | Hertha BSC II | - | Holstein Kiel | 3:0 | ||||
| 8. Journée | 17.09.2006 | Bor. Mönchengladbach II | - | Hertha BSC II | 1:1 | ||||
| 14. Journée | 04.11.2006 | 1. FC Magdeburg | - | Hertha BSC II | 2:0 | ||||
| 15. Journée | 08.11.2006 | Hertha BSC II | - | Wuppertaler SV | 0:1 | ||||
| 16. Journée | 12.11.2006 | Borussia Dortmund II | - | Hertha BSC II | 1:1 | |
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| 17. Journée | 19.11.2006 | Hertha BSC II | - | VfB Lübeck | 1:0 | ||||
| 18. Journée | 26.11.2006 | Werder Bremen II | - | Hertha BSC II | 0:1 | |
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| 20. Journée | 09.12.2006 | 1. FC Union Berlin | - | Hertha BSC II | 2:2 | ||||
| 33. Journée | 27.04.2007 | Hertha BSC II | - | 1. FC Magdeburg | 0:2 |
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