| 18. Journée | 13.07.2015 | Tulevik Viljandi | - | FC Flora | 0:4 |  |
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| 19. Journée | 20.07.2015 | FC Flora | - | Paide Linnameeskond | 1:0 | ||||
| 27. Journée | 03.08.2015 | JK Sillamäe Kalev | - | FC Flora | 0:1 | |
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| 22. Journée | 08.08.2015 | FC Flora | - | JK Narva Trans | 2:3 | ||||
| 23. Journée | 14.08.2015 | Pärnu Linnameeskond | - | FC Flora | 1:5 | ||||
| 25. Journée | 21.08.2015 | JK Tammeka | - | FC Flora | 1:4 | |
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| 31. Journée | 26.09.2015 | Tulevik Viljandi | - | FC Flora | 0:1 | ||||
| 35. Journée | 31.10.2015 | FC Levadia | - | FC Flora | 0:2 | ||||
| 36. Journée | 07.11.2015 | Paide Linnameeskond | - | FC Flora | 2:1 |
Estonie