| 1. Journée | 01.08.2016 | FK Krasnodar | - | FK Tom Tomsk | 3:0 |  |
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| 2. Journée | 08.08.2016 | FK Krasnodar | - | Terek Grozny | 4:0 | |
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| 3. Journée | 13.08.2016 | Krylia Sovetov | - | FK Krasnodar | 1:1 | ||||
| 4. Journée | 21.08.2016 | Spartak Moskva | - | FK Krasnodar | 2:0 | ||||
| 5. Journée | 28.08.2016 | FK Krasnodar | - | Lokomotiv Moskva | 1:2 | ||||
| 6. Journée | 11.09.2016 | FK Ufa | - | FK Krasnodar | 0:0 | ||||
| 9. Journée | 02.10.2016 | FK Krasnodar | - | Rubin Kazan | 1:0 | |
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| 10. Journée | 16.10.2016 | Arsenal Tula | - | FK Krasnodar | 0:0 | ||||
| 11. Journée | 23.10.2016 | FK Krasnodar | - | FK Amkar Perm | 1:0 | ||||
| 13. Journée | 06.11.2016 | FK Krasnodar | - | FK Orenburg | 3:3 | |
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| 14. Journée | 20.11.2016 | FK Krasnodar | - | FK Ural | 3:0 |
Brésil
