| 1. Journée | 05.03.2016 | JK Nõmme Kalju | - | JK Sillamäe Kalev | 2:0 | ||||
| 2. Journée | 09.03.2016 | FC Infonet | - | JK Nõmme Kalju | 2:1 | ||||
| 3. Journée | 12.03.2016 | JK Nõmme Kalju | - | Rakvere JK Tarvas | 3:1 | ||||
| 4. Journée | 19.03.2016 | JK Nõmme Kalju | - | FC Flora | 2:0 | ||||
| 5. Journée | 02.04.2016 | FC Levadia | - | JK Nõmme Kalju | 1:1 | ||||
| 8. Journée | 15.04.2016 | JK Tammeka | - | JK Nõmme Kalju | 0:3 | ||||
| 9. Journée | 23.04.2016 | JK Nõmme Kalju | - | Paide Linnameeskond | 1:0 |  |
|||
| 17. Journée | 26.04.2016 | JK Nõmme Kalju | - | FC Infonet | 2:1 | ||||
| 10. Journée | 30.04.2016 | Paide Linnameeskond | - | JK Nõmme Kalju | 1:1 | ||||
| 11. Journée | 07.05.2016 | JK Nõmme Kalju | - | JK Tammeka | 2:0 | ||||
| 15. Journée | 10.05.2016 | FC Flora | - | JK Nõmme Kalju | 0:0 | ||||
| 12. Journée | 14.05.2016 | JK Narva Trans | - | JK Nõmme Kalju | 1:1 | ||||
| 13. Journée | 17.05.2016 | JK Nõmme Kalju | - | Pärnu Linnameeskond | 3:0 | ||||
| 14. Journée | 24.05.2016 | JK Nõmme Kalju | - | FC Levadia | 0:1 | ||||
| 16. Journée | 19.06.2016 | JK Sillamäe Kalev | - | JK Nõmme Kalju | 1:3 | ||||
| 18. Journée | 10.07.2016 | Rakvere JK Tarvas | - | JK Nõmme Kalju | 1:6 |
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