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| 18.10.2008 | 14:00 | FC DAC 1904 | - | FC Nitra | 1:0 (1:0) | |
| 17:00 | Zlaté Moravce | - | MŠK Žilina | 0:2 (0:2) | ||
| 17:00 | MFK Ružomberok | - | MFK Košice | 0:0 | ||
| 17:30 | MFK Dubnica | - | Spartak Trnava | 0:1 (0:0) | ||
| 20:15 | FK Dukla Banská Bystrica | - | Slovan Bratislava | 2:3 (2:0) | ||
| 19.10.2008 | 17:15 | 1. FC Tatran Prešov | - | FC Artmedia Petržalka | 1:0 (0:0) |
| » Classement | équipe recevante | à l'extérieur | Premier tour | Second tour |
| # | Équipe | M. | G. | N. | P. | Buts | Diff. | Pts. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
MŠK Žilina | 12 | 7 | 3 | 2 | 22:6 | 16 | 24 |
| 2 |
|
Slovan Bratislava | 12 | 7 | 3 | 2 | 22:10 | 12 | 24 |
| 3 |
|
MFK Košice | 12 | 7 | 3 | 2 | 21:15 | 6 | 24 |
| 4 |
|
Spartak Trnava | 12 | 6 | 4 | 2 | 16:9 | 7 | 22 |
| 5 |
|
FC DAC 1904 | 12 | 5 | 3 | 4 | 16:13 | 3 | 18 |
| 6 |
|
1. FC Tatran Prešov | 12 | 5 | 2 | 5 | 16:22 | -6 | 17 |
| 7 |
|
MFK Ružomberok | 12 | 3 | 5 | 4 | 13:13 | 0 | 14 |
| 8 |
|
FC Nitra | 12 | 4 | 1 | 7 | 11:24 | -13 | 13 |
| 9 |
|
FC Artmedia Petržalka | 12 | 3 | 3 | 6 | 14:17 | -3 | 12 |
| 10 |
|
FK Dukla Banská Bystrica | 12 | 3 | 3 | 6 | 8:12 | -4 | 12 |
| 11 |
|
MFK Dubnica | 12 | 3 | 2 | 7 | 15:19 | -4 | 11 |
| 12 |
|
Zlaté Moravce | 12 | 1 | 4 | 7 | 4:18 | -14 | 7 |
