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| H (Match allé) | Metalurg Skopje | - | FK Turnovo | 3:3 | ||
| R (match retour) | FK Turnovo | - | Metalurg Skopje | 0:1 | ||
| H (Match allé): 09.09.2012 15:30 | R (match retour): 26.09.2012 15:00 | vainqueur: Metalurg Skopje | ||||
| H (Match allé) | Lokomotiva Skopje | - | FK Teteks | 0:2 | ||
| R (match retour) | FK Teteks | - | Lokomotiva Skopje | 7:0 (2:0) | ||
| H (Match allé): 09.09.2012 15:30 | R (match retour): 26.09.2012 15:00 | vainqueur: FK Teteks | ||||
| H (Match allé) | KF Shkëndija 79 | - | FK Bregalnica Štip | 1:0 | ||
| R (match retour) | FK Bregalnica Štip | - | KF Shkëndija 79 | 0:1 | ||
| H (Match allé): 09.09.2012 15:30 | R (match retour): 26.09.2012 15:00 | vainqueur: KF Shkëndija 79 | ||||
| H (Match allé) | KF Bashkimi | - | Sileks Kratovo | 0:1 | ||
| R (match retour) | Sileks Kratovo | - | KF Bashkimi | 3:0 | ||
| H (Match allé): 09.09.2012 15:30 | R (match retour): 26.09.2012 15:00 | vainqueur: Sileks Kratovo | ||||
| H (Match allé) | FK Pelister | - | Babi Štip | 5:0 | ||
| R (match retour) | Babi Štip | - | FK Pelister | 1:1 (1:1) | ||
| H (Match allé): 09.09.2012 15:30 | R (match retour): 27.09.2012 15:00 | vainqueur: FK Pelister | ||||
| H (Match allé) | FK Viktorija | - | FK Drita | 0:0 | ||
| R (match retour) | FK Drita | - | FK Viktorija | 2:0 | ||
| H (Match allé): 09.09.2012 15:30 | R (match retour): 26.09.2012 15:00 | vainqueur: FK Drita | ||||
| H (Match allé) | 11 Oktomvri | - | FK Renova | 0:5 | ||
| R (match retour) | FK Renova | - | 11 Oktomvri | 5:0 | ||
| H (Match allé): 09.09.2012 15:30 | R (match retour): 26.09.2012 15:00 | vainqueur: FK Renova | ||||
| H (Match allé) | Vardar Skopje | - | FK Gorno Lisiče | 2:0 (2:0) | ||
| R (match retour) | FK Gorno Lisiče | - | Vardar Skopje | 1:2 | ||
| H (Match allé): 19.09.2012 20:00 | R (match retour): 26.09.2012 15:00 | vainqueur: Vardar Skopje | ||||
