| 4. Journée | 11.09.2016 | Lorca FC | - | UD Melilla | 0:2 |  |
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| 8. Journée | 08.10.2016 | UD Melilla | - | FC Cartagena | 1:1 | |
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| 10. Journée | 23.10.2016 | UD Melilla | - | Real Jaén | 2:1 | ||||
| 11. Journée | 30.10.2016 | Atlético Sanluqueño CF | - | UD Melilla | 1:2 | ||||
| 12. Journée | 02.11.2016 | UD Melilla | - | Extremadura UD | 0:1 | ||||
| 13. Journée | 06.11.2016 | CF Villanovense | - | UD Melilla | 3:1 | ||||
| 14. Journée | 13.11.2016 | UD Melilla | - | FC Jumilla | 0:0 | ||||
| 15. Journée | 20.11.2016 | RB Linense | - | UD Melilla | 2:1 | ||||
| 16. Journée | 27.11.2016 | UD Melilla | - | Recreativo Huelva | 0:0 | ||||
| 17. Journée | 04.12.2016 | Linares Deportivo | - | UD Melilla | 1:2 | ||||
| 18. Journée | 11.12.2016 | UD Melilla | - | Córdoba CF B | 2:1 | ||||
| 25. Journée | 12.02.2017 | Granada CF B | - | UD Melilla | 1:1 | ||||
| 30. Journée | 19.03.2017 | UD Melilla | - | Atlético Sanluqueño CF | 1:0 | ||||
| 38. Journée | 14.05.2017 | UD Melilla | - | Atlético Mancha Real | 1:2 |
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