| 16. Journée | 08.03.2025 | Vysočina Jihlava [B-jeun] | - | FC Zlín [B-jeun] | 6:3 | ||||
| 17. Journée | 14.03.2025 | FC Zlín [B-jeun] | - | FK Mladá Boleslav [B-jeun] | 2:2 | ||||
| 18. Journée | 22.03.2025 | FK Pardubice [B-jeun] | - | FC Zlín [B-jeun] | 4:0 | ||||
| 19. Journée | 29.03.2025 | FC Zlín [B-jeun] | - | Slavia Praha [B-jeun] | 3:7 | ||||
| 20. Journée | 05.04.2025 | FK Jablonec [B-jeun] | - | FC Zlín [B-jeun] | 1:2 | ||||
| 21. Journée | 12.04.2025 | FC Zlín [B-jeun] | - | Slovan Liberec [B-jeun] | 0:0 | ||||
| 22. Journée | 18.04.2025 | SFC Opava [B-jeun] | - | FC Zlín [B-jeun] | 0:1 | ||||
| 25. Journée | 10.05.2025 | Sigma Olomouc [B-jeun] | - | FC Zlín [B-jeun] | 7:0 | ||||
| 28. Journée | 31.05.2025 | FC Zlín [B-jeun] | - | Dynamo České Budějovice [B-jeun] | 0:4 | ||||
| 29. Journée | 06.06.2025 | FK Dukla Praha [B-jeun] | - | FC Zlín [B-jeun] | 2:0 |
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