| Groupe B | 15.09.2016 | APOEL Nikosia | - | FK Astana | 2:1 |  |
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| Groupe B | 29.09.2016 | Olympiakos Piraeus | - | APOEL Nikosia | 0:1 | ||||
| Groupe B | 20.10.2016 | BSC Young Boys | - | APOEL Nikosia | 3:1 | ||||
| Groupe B | 03.11.2016 | APOEL Nikosia | - | BSC Young Boys | 1:0 | ||||
| Groupe B | 24.11.2016 | FK Astana | - | APOEL Nikosia | 2:1 | ||||
| Groupe B | 08.12.2016 | APOEL Nikosia | - | Olympiakos Piraeus | 2:0 | ||||
| Seizièmes de finale | 16.02.2017 | Athletic Club | - | APOEL Nikosia | 3:2 | ||||
| Seizièmes de finale | 23.02.2017 | APOEL Nikosia | - | Athletic Club | 2:0 |
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