| 1er tour | 14.09.2006 | Olympique Marseille | - | FK Mladá Boleslav | 1:0 | ||||
| 1er tour | 28.09.2006 | FK Mladá Boleslav | - | Olympique Marseille | 4:2 | ||||
| Groupe G | 02.11.2006 | FK Mladá Boleslav | - | Panathinaikos | 0:1 | ||||
| Groupe G | 23.11.2006 | Rapid Bucureşti | - | FK Mladá Boleslav | 1:1 | ||||
| Groupe G | 30.11.2006 | FK Mladá Boleslav | - | Paris Saint-Germain | 0:0 |  |
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| Groupe G | 13.12.2006 | Hapoel Tel Aviv | - | FK Mladá Boleslav | 1:1 | |
République Tchèque