| 20. Journée | 22.03.2025 | FC Zlín B | - | FC Strání | 3:1 | ||||
| 25. Journée | 27.04.2025 | 1. FC Slovácko B | - | FC Zlín B | 1:0 | ||||
| 33. Journée | 30.04.2025 | FC Zlín B | - | FK Blansko | 4:2 | ||||
| 26. Journée | 04.05.2025 | FC Zlín B | - | FK Frýdek-Místek | 4:4 | ||||
| 27. Journée | 10.05.2025 | FC Slovan Rosice | - | FC Zlín B | 3:1 | ||||
| 32. Journée | 14.05.2025 | FC Zbrojovka Brno B | - | FC Zlín B | 3:0 | ||||
| 28. Journée | 17.05.2025 | FC Zlín B | - | TJ Start Brno | 2:3 | ||||
| 34. Journée | 21.05.2025 | ČSK Uherský Brod | - | FC Zlín B | 2:2 | ||||
| 29. Journée | 24.05.2025 | FC Hlučín | - | FC Zlín B | 2:1 | ||||
| 30. Journée | 31.05.2025 | FC Zlín B | - | MFK Karviná B | 3:2 |  |
|||
| 31. Journée | 07.06.2025 | FC Zlín B | - | 1. SC Znojmo | 2:1 |
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