| 7. Journée | 27.09.2002 | Waldhof Mannheim | - | FC St. Pauli | 2:5 | ||||
| 8. Journée | 04.10.2002 | FC St. Pauli | - | Rot-Weiß Oberhausen | 0:0 | ||||
| 9. Journée | 20.10.2002 | SSV Reutlingen | - | FC St. Pauli | 2:0 | ||||
| 10. Journée | 27.10.2002 | FC St. Pauli | - | Eintracht Trier | 0:0 | ||||
| 11. Journée | 01.11.2002 | FC St. Pauli | - | SC Freiburg | 0:1 | ||||
| 12. Journée | 10.11.2002 | SpVgg Greuther Fürth | - | FC St. Pauli | 2:1 | ||||
| 13. Journée | 18.11.2002 | FC St. Pauli | - | 1. FC Köln | 2:3 |  |
|||
| 14. Journée | 24.11.2002 | Wacker Burghausen | - | FC St. Pauli | 1:1 | ||||
| 15. Journée | 02.12.2002 | FC St. Pauli | - | Karlsruher SC | 1:2 | ||||
| 16. Journée | 06.12.2002 | MSV Duisburg | - | FC St. Pauli | 2:1 | ||||
| 17. Journée | 13.12.2002 | FC St. Pauli | - | Alemannia Aachen | 1:4 | ||||
| 19. Journée | 02.02.2003 | LR Ahlen | - | FC St. Pauli | 3:2 | ||||
| 30. Journée | 28.04.2003 | 1. FC Köln | - | FC St. Pauli | 2:1 |
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