1. Journée 19.09.1999 Iraklis Saloniki - Apollon Smyrnis 1:0
2. Journée 25.09.1999 Apollon Smyrnis - Paniliakos Pyrgos 0:0
3. Journée 03.10.1999 Apollon Smyrnis - Olympiakos Piraeus 0:1
4. Journée 17.10.1999 Ionikos Nikea - Apollon Smyrnis 1:0
5. Journée 24.10.1999 Apollon Smyrnis - Aris Saloniki 3:3 but carton jaune
6. Journée 01.11.1999 OFI Heraklion - Apollon Smyrnis 1:0
7. Journée 07.11.1999 Apollon Smyrnis - Skoda Xanthi 0:0
8. Journée 21.11.1999 Panachaiki GE - Apollon Smyrnis 1:2 carton jaune
10. Journée 05.12.1999 Panionios GSS - Apollon Smyrnis 3:1
11. Journée 11.12.1999 Kalamata - Apollon Smyrnis 1:1
12. Journée 22.12.1999 Apollon Smyrnis - AO Kavala 0:2
13. Journée 29.12.1999 AO Trikala - Apollon Smyrnis 1:0
14. Journée 08.01.2000 Apollon Smyrnis - AEK Athen 3:2 carton jaune
15. Journée 16.01.2000 PAOK Saloniki - Apollon Smyrnis 1:1
16. Journée 22.01.2000 Apollon Smyrnis - Panathinaikos 0:3
17. Journée 30.01.2000 Ethnikos Asteras - Apollon Smyrnis 3:1
18. Journée 07.02.2000 Apollon Smyrnis - Iraklis Saloniki 1:0
19. Journée 13.02.2000 Paniliakos Pyrgos - Apollon Smyrnis 2:1 but
20. Journée 20.02.2000 Olympiakos Piraeus - Apollon Smyrnis 2:0 carton jaune
23. Journée 13.03.2000 Apollon Smyrnis - OFI Heraklion 1:2 carton rouge indirect
25. Journée 26.03.2000 Apollon Smyrnis - Panachaiki GE 0:0
26. Journée 02.04.2000 AO Proodeftiki - Apollon Smyrnis 2:0 carton jaune
29. Journée 23.04.2000 AO Kavala - Apollon Smyrnis 1:3 carton jaune
30. Journée 03.05.2000 Apollon Smyrnis - AO Trikala 5:2 but
31. Journée 07.05.2000 AEK Athen - Apollon Smyrnis 3:0
32. Journée 13.05.2000 Apollon Smyrnis - PAOK Saloniki 3:4 but