| 2. Journée | 05.08.2012 | Atlético Junior | - | Real Cartagena | 1:0 |  |
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| 3. Journée | 12.08.2012 | Atlético Junior | - | Deportivo Pasto | 2:0 |  |
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| 4. Journée | 20.08.2012 | Deportivo Cali | - | Atlético Junior | 1:1 | |
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| 5. Journée | 26.08.2012 | Atlético Junior | - | Envigado FC | 2:0 | |
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| 6. Journée | 29.08.2012 | Itagüi Ditaires | - | Atlético Junior | 1:1 | |
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| 8. Journée | 17.09.2012 | Boyacá Chicó | - | Atlético Junior | 1:1 | |
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| 9. Journée | 24.09.2012 | Real Cartagena | - | Atlético Junior | 1:3 | |
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| 10. Journée | 27.09.2012 | Atlético Junior | - | Santa Fe | 1:1 | |
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| 11. Journée | 30.09.2012 | Millonarios | - | Atlético Junior | 2:0 |  |
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| 13. Journée | 06.10.2012 | Deportes Tolima | - | Atlético Junior | 2:2 |  |
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| 17. Journée | 04.11.2012 | Independiente Medellín | - | Atlético Junior | 2:1 | ||||
| 18. Journée | 10.11.2012 | Atlético Junior | - | Once Caldas | 2:0 |
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