| 20. Journée | 10.12.2016 | Leyton Orient | - | Accrington Stanley | 1:0 | ||||
| 21. Journée | 17.12.2016 | Wycombe Wanderers | - | Leyton Orient | 1:0 | ||||
| 22. Journée | 26.12.2016 | Leyton Orient | - | Crawley Town | 3:2 | ||||
| 23. Journée | 31.12.2016 | Leyton Orient | - | Cambridge United | 1:1 | ||||
| 25. Journée | 07.01.2017 | Leyton Orient | - | Barnet FC | 1:3 |  |
|||
| 26. Journée | 14.01.2017 | Portsmouth FC | - | Leyton Orient | 2:1 | ||||
| 28. Journée | 28.01.2017 | Mansfield Town | - | Leyton Orient | 2:0 | ||||
| 29. Journée | 04.02.2017 | Leyton Orient | - | Carlisle United | 1:2 | ||||
| 32. Journée | 18.02.2017 | Leyton Orient | - | Notts County | 2:3 |  |
|||
| 33. Journée | 25.02.2017 | Leyton Orient | - | Cheltenham Town | 0:1 | ||||
| 35. Journée | 04.03.2017 | Newport County | - | Leyton Orient | 0:4 | ||||
| 37. Journée | 14.03.2017 | Accrington Stanley | - | Leyton Orient | 5:0 | ||||
| 39. Journée | 25.03.2017 | Crawley Town | - | Leyton Orient | 3:0 | ||||
| 40. Journée | 01.04.2017 | Leyton Orient | - | Wycombe Wanderers | 0:2 | ||||
| 42. Journée | 14.04.2017 | Luton Town | - | Leyton Orient | 2:2 | ||||
| 43. Journée | 17.04.2017 | Leyton Orient | - | Hartlepool United | 2:1 | ||||
| 44. Journée | 22.04.2017 | Crewe Alexandra | - | Leyton Orient | 3:0 |
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