| 1. Journée | 02.08.2024 | FC Zlínsko | - | FC Zlín B | 3:0 | ||||
| 17. Journée | 11.09.2024 | FC Zlín B | - | ČSK Uherský Brod | 0:1 |  |
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| 16. Journée | 16.11.2024 | FK Blansko | - | FC Zlín B | 2:4 |  |
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| 21. Journée | 29.03.2025 | Hanácká Slávia Kroměříž | - | FC Zlín B | 5:0 | ||||
| 19. Journée | 02.04.2025 | SK Uničov | - | FC Zlín B | 2:1 | ||||
| 22. Journée | 05.04.2025 | FC Zlín B | - | TJ Unie Hlubina | 0:0 | |
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| 23. Journée | 12.04.2025 | FK Třinec | - | FC Zlín B | 4:0 | ||||
| 24. Journée | 18.04.2025 | FC Zlín B | - | FK Hodonín | 0:0 | ||||
| 25. Journée | 27.04.2025 | 1. FC Slovácko B | - | FC Zlín B | 1:0 | ||||
| 33. Journée | 30.04.2025 | FC Zlín B | - | FK Blansko | 4:2 | ||||
| 26. Journée | 04.05.2025 | FC Zlín B | - | FK Frýdek-Místek | 4:4 | |
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| 27. Journée | 10.05.2025 | FC Slovan Rosice | - | FC Zlín B | 3:1 | ||||
| 28. Journée | 17.05.2025 | FC Zlín B | - | TJ Start Brno | 2:3 | ||||
| 29. Journée | 24.05.2025 | FC Hlučín | - | FC Zlín B | 2:1 | ||||
| 30. Journée | 31.05.2025 | FC Zlín B | - | MFK Karviná B | 3:2 | |
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