| Groupe G | 17.09.2009 | Lazio Roma | - | RB Salzburg | 1:2 | ||||
| Groupe G | 01.10.2009 | RB Salzburg | - | Villarreal CF | 2:0 | ||||
| Groupe G | 22.10.2009 | RB Salzburg | - | Levski Sofia | 1:0 | ||||
| Groupe G | 02.12.2009 | RB Salzburg | - | Lazio Roma | 2:1 | ||||
| Groupe G | 17.12.2009 | Villarreal CF | - | RB Salzburg | 0:1 |  |
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| 2e tour | 18.02.2010 | Standard Liège | - | RB Salzburg | 3:2 | ||||
| 2e tour | 25.02.2010 | RB Salzburg | - | Standard Liège | 0:0 | |
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