| 1. Journée | 31.07.2016 | El Nacional | - | Deportivo Cuenca | 2:3 |  |
|||
| 2. Journée | 06.08.2016 | Deportivo Cuenca | - | Aucas | 1:1 | ||||
| 3. Journée | 13.08.2016 | Mushuc Runa | - | Deportivo Cuenca | 3:2 | |
|||
| 4. Journée | 20.08.2016 | Deportivo Cuenca | - | Club Deportivo River Plate Ecuador | 3:0 | ||||
| 5. Journée | 27.08.2016 | Emelec | - | Deportivo Cuenca | 2:1 | ||||
| 6. Journée | 03.09.2016 | Deportivo Cuenca | - | Fuerza Amarilla | 3:2 |  |
|||
| 9. Journée | 21.09.2016 | Delfín SC | - | Deportivo Cuenca | 2:2 | ||||
| 10. Journée | 25.09.2016 | Deportivo Cuenca | - | Barcelona | 0:1 | |
|||
| 11. Journée | 01.10.2016 | LDU Quito | - | Deportivo Cuenca | 1:2 | |
|||
| 12. Journée | 08.10.2016 | Deportivo Cuenca | - | LDU Quito | 0:0 | ||||
| 13. Journée | 15.10.2016 | Barcelona | - | Deportivo Cuenca | 5:0 | ||||
| 14. Journée | 20.10.2016 | Deportivo Cuenca | - | Delfín SC | 3:1 | ||||
| 15. Journée | 23.10.2016 | Universidad Catolica | - | Deportivo Cuenca | 3:2 | ||||
| 16. Journée | 30.10.2016 | Deportivo Cuenca | - | Independiente del Valle | 0:1 | |
|||
| 19. Journée | 19.11.2016 | Club Deportivo River Plate Ecuador | - | Deportivo Cuenca | 2:1 | |
Équateur