| Groupe B | 24.08.2016 | Comerciantes Unidos | - | Universitario de Deportes | 1:1 | ||||
| Groupe B | 11.09.2016 | Universitario de Deportes | - | Sport Huancayo | 1:0 | ||||
| Groupe B | 18.09.2016 | Alianza Lima | - | Universitario de Deportes | 1:1 | ||||
| Groupe B | 20.11.2016 | Universitario de Deportes | - | Universidad Técnica | 1:1 | ||||
| Groupe B | 23.11.2016 | Ayacucho FC | - | Universitario de Deportes | 1:1 | ||||
| Groupe B | 27.11.2016 | Universitario de Deportes | - | Universidad San Martín | 0:1 |  |
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