| 13. Journée | 02.12.2012 | Panionios GSS | - | Panathinaikos | 1:2 | ||||
| 14. Journée | 09.12.2012 | Panathinaikos | - | Olympiakos Piraeus | 2:2 | ||||
| 15. Journée | 16.12.2012 | Veria FC | - | Panathinaikos | 3:0 | ||||
| 17. Journée | 13.01.2013 | PAS Giannina | - | Panathinaikos | 0:0 |  |
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| 18. Journée | 19.01.2013 | Panathinaikos | - | Panthrakikos | 1:1 | ||||
| 19. Journée | 27.01.2013 | Atromitos | - | Panathinaikos | 1:2 | ||||
| 20. Journée | 02.02.2013 | Asteras Tripolis | - | Panathinaikos | 2:2 | |
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| 21. Journée | 10.02.2013 | Panathinaikos | - | Skoda Xanthi | 0:1 | |
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| 22. Journée | 17.02.2013 | Aris Saloniki | - | Panathinaikos | 1:0 | ||||
| 23. Journée | 23.02.2013 | Panathinaikos | - | OFI Heraklion | 3:1 | |
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| 24. Journée | 03.03.2013 | AEK Athen | - | Panathinaikos | 0:2 |  |
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| 25. Journée | 09.03.2013 | Panathinaikos | - | AO Kerkyra | 1:0 | ||||
| 26. Journée | 17.03.2013 | PAOK Saloniki | - | Panathinaikos | 2:0 |  |
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| 29. Journée | 14.04.2013 | Olympiakos Piraeus | - | Panathinaikos | 1:1 | |
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| 30. Journée | 21.04.2013 | Panathinaikos | - | Veria FC | 3:2 | |
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